Комиссия и Научный комитет сотрудничают с межправительственными и неправительственными организациями на взаимовыгодной основе. Сотрудничество может осуществляться неформальным образом или в соответствующих случаях на основе официального соглашения.

АНТКОМ поддерживает взаимовыгодные отношения с широким диапазоном других многосторонних организаций и отраслевых ассоциаций, а также с общественностью. Статья XXIII Конвенция АНТКОМ гласит:

1. Комиссия и Научный комитет сотрудничают с государствами-участниками Консультативных совещаний по Договору об Антарктике по вопросам, входящим в компетенцию последних.
2. Комиссия и Научный комитет сотрудничают, в соответствующих случаях, с Продовольственной и сельскохозяйственной организацией Организации Объединенных Наций и другими специализированными учреждениями.
3. Комиссия и Научный комитет будут стремиться развивать, в соответствующих случаях, рабочие отношения сотрудничества с межправительственными и неправительственными организациями, которые могут содействовать их работе, включая Научный комитет по антарктическим исследованиям, Научный комитет по океаническим исследованиям и Международную китобойную комиссию.
4. Комиссия может в соответствующих случаях заключить соглашения с упомянутыми в настоящей Статье организациями и другими организациями. Комиссия и Научный комитет могут приглашать такие организации направить наблюдателей на свои сессии и сессии их вспомогательных органов.

Недоговаривающиеся Стороны

Каждый год недоговаривающимся сторонам, которые, возможно, вовлечены в выгрузки и/или торговлю клыкачом, направляется предложение сотрудничать с АНТКОМ путем добровольного применения Системы документации уловов (СДУ).

Недоговаривающиеся стороны с ограниченным доступом к СДУ:

• Сингапуру (2018 г.) был предоставлен бессрочный ограниченный доступ к Э-СДУ АНТКОМ с целью верификации документов на экспорт и выдачи документов на экспорт.
• Мексике (2021 г.) был предоставлен ограниченный доступ к Э-СДУ АНТКОМ с целью верификации документов на экспорт и выдачи документов на реэкспорт.

Межправительственные организации

Комиссия и Научный комитет сотрудничают со следующими межправительственными и неправительственными организациями, в том числе путем участия в совещаниях друг друга в качестве наблюдателей (МОВ и соглашения имеются только на английском языке):

• Соглашение о сохранении альбатросов и буревестников (ACAP) (МОВ ACAP (4.75 МБ))
• Комиссия по сохранению южного синего тунца (CCSBT) (Соглашение c CCSBT (491.31 КБ))
• Комитет по охране окружающей среды (КООС)
• Конвенция о международной торговле видами, находящимися под угрозой исчезновения (СИТЕС)
• Постоянная комиссия по Южной части Тихого океана (CPPS)
• Продовольственная и сельскохозяйственная организация Объединенных Наций (ФАО)
• Промысловое агентство Форума тихоокеанских островов (ПАФ)
• Межамериканская комиссия по проблемам тропического тунца (IATTC)
• Межправительственная океанографическая комиссия (МОК)
• Международный союз охраны природы (МСОП)
• Международная китобойная комиссия (МКК)
• Научный комитет по антарктическим исследованиям (СКАР)
• Научный комитет по океаническим исследованиям (СКОР)
• Организация по рыболовству в Юго-Восточной Атлантике (СЕАФО) (Соглашение с СЕАФО (962.06 КБ) – Arrangement Companion Document (76.53 КБ))
• Секретариат Тихоокеанского Сообщества (SPC)
• Южно-Тихоокеанская региональная рыбохозяйственная организация (ЮТРРХО) (Соглашение ЮТРРХО (480.56 КБ))
• Соглашение о рыболовстве в южной части Индийского океана (SIOFA) (Arrangement SIOFA (101.93 КБ) – Arrangement Companion Document (76.53 КБ))
• Программа ООН по вопросам окружающей среды (ЮНЕП)
• Комиссия по рыбному промыслу в западной и центральной частях Тихого океана (WCPFC) (Соглашение WCPFC (1.08 МБ)).

Неправительственные организации

Комиссия также сотрудничает с:

• Коалицией по Антарктике и Южному океану (АСОК)
• Ассоциацией ответственных крилепромысловых компаний (АОК)
• Коалицией законных операторов промысла клыкача (COLTO)
• Oceanites.

Другое сотрудничество

АНТКОМ является:

• Членом Сети секретариатов региональных органов по рыболовству (RSN)
• членом Координационной рабочей группы по статистике рыбного хозяйства (КРГ)
• партнером в Системе мониторинга рыбопромысловых ресурсов (FIRMS).

Центр данных Секретариата АНТКОМ участвует в партнерствах с несколькими организациями (Партнерские отношения).